2月7日，神州数码发布澄清公告称，集团目前正就该处罚提出复议，因为神州数码(中国)在有关购买资讯科技产品的政府采购项目竞标过程中已履行一切适用的程序。 神州数码(中国)是公司在中国大陆的全资附属公司之一，政府业务不是其主要业务，神州数码（中国）对中国政府机关的销售总额占本集团同期销售总额不足0.4%，董事会并不预期该处罚会对集团的销售及分销业务或其他业务产生任何重大影响。

国金证券分析师赵国栋认为，神州数码（中国）被财政部处罚事实上是公司公信力的破产。

神州数码（中国）承诺提供国产设备，最终提供的却是海外产品。对此，赵国栋指出，这个问题发生的实质是，政府日益高涨的国产化需求，和神州数码代理分销大部分国外产品之间存在结构性矛盾。

摩根大通发表的研究报告也指出，这次事件对公司直接财务影响较少，但是此次事件暗示，国内制造的IT产品在新领导层的管理下，会以国家安全名义下得到较多好处。若这是事实，将对公司会有负面影响，因公司是国内最大的美国IT产品经销商。

赵国栋分析称，神州数码一向是销售导向文化，在层层考核的重压之下，销售人员作假，已经不是个案。销售导向并不等于关系导向，一旦关系导向，往往就会迷信关系，依赖关系而不能自拔。这种思维发酵，就会导致没有人想价值实现这回事儿。这种思维也是神州数码为什么这多年没有过硬的产品的主要原因。

此外，赵国栋还称，公司澄清公告冠冕堂皇，看不出任何正视问题、解决问题的诚意。

赵国栋认为，公司澄清公告至少应该包括以下内容：“第一，罗列神州数码（中国）跟其他法人体的合同额，让大家实实在在看到，该法人体即便全部被禁，最坏的影响是多少金额？避免恐慌性的猜测；第二，跟政府积极沟通，大约圈定“政府”采购的范围，哪些算政府订单，不要让大家猜测，金融算政府吗？电信算不算？第三神州数码主打的概念智慧城市的订单有多少和该法人体相关，这算是政府采购吗？这是个核心的大问题；第四，该法人体有哪些重要资质，有哪些解决措施等。神码旗下有许多法人体，地方性的分公司等等，坏了一个本无多少大事，但是要有证据让人相信你有变通的手段。这样才能让大家信服。而不仅仅是弄出一个政府釆购额仅占0.4这么个数字。”